推薦意見(jiàn)1：

實(shí)時(shí)熒光PCR包括單靶標或多靶標呼吸道病原體核酸檢測，可作為核酸即時(shí)檢測法的參考方法，主要適用于門(mén)急診、住院患者和大規模人群篩查。

推薦意見(jiàn)2：

免疫功能正常、存在住院風(fēng)險的氣管支氣管炎成人患者。針對此類(lèi)人群，建議采用多靶標病原體核酸檢測技術(shù)明確病原，以縮短抗生素使用時(shí)間和患者住院時(shí)間。

推薦意見(jiàn)3：

建議對重癥社區獲得性肺炎患者同時(shí)進(jìn)行常規病原學(xué)檢查和核酸檢測，以提高病原體檢出率。

推薦意見(jiàn)4：

醫院獲得性肺炎和呼吸機相關(guān)肺炎患者，病原學(xué)診斷應以傳統培養方法為主，必要時(shí)聯(lián)合采用多靶標病原體核酸檢測，無(wú)需常規行mNGS，僅在患者存在免疫缺陷、3d內未通過(guò)傳統微生物檢驗明確病原體且經(jīng)驗性抗感染治療無(wú)效時(shí)，考慮行以DNA測序為主的mNGS。

需根據疾病流行情況、患者病情嚴重程度、癥狀持續時(shí)間、合并癥情況、免疫抑制狀態(tài)評估結果、其他輔助檢查結果的可參考性以及對預后的初步評判，決定是否對疑似急性上呼吸道感染的上述患者進(jìn)行檢測。

新型冠狀病毒肺炎或流感大流行期間，快速分子檢測有助于預檢分診、縮短就診時(shí)間、減少傳染病傳播風(fēng)險；又如，當患者免疫功能?chē)乐厥軗p，同時(shí)疑似流感樣癥狀時(shí)，或者呼吸道病毒檢測可能會(huì )影響醫生抗病毒藥物或停用抗生素的決定時(shí)，需要對呼吸道病毒進(jìn)行檢測。

在流行風(fēng)險高的季節，高危人群（老年人、兒童、孕產(chǎn)婦、合并基礎疾病患者）進(jìn)行流感病毒檢測可能比經(jīng)驗性抗流感治療更經(jīng)濟。此外，快速的結果反饋（如2h內即出結果的快速分子檢測）能夠縮短患者門(mén)急診就診時(shí)間，降低流感傳播風(fēng)險，有利于傳染病控制。

在流感病毒、新型冠狀病毒等大流行期間，門(mén)急診針對上述兩種病毒的抗原檢測或分子診斷技術(shù)有助于快速分診并指導隔離防控，避免院內傳播，但前者敏感性低于后者。對于免疫功能正常且存在住院風(fēng)險的成人患者而言，盡快采用多重PCR技術(shù)明確病原，可能會(huì )縮短抗生素使用時(shí)間和住院時(shí)間，但兒童毛細支氣管炎患者并不推薦常規病毒檢測。

若懷疑為支原體、衣原體、軍團菌、病毒等感染時(shí)，可采用血清特異性抗原、抗體檢測聯(lián)合核酸檢測和分離培養；實(shí)時(shí)熒光PCR、等溫擴增、數字PCR、高通量測序技術(shù)可同時(shí)檢測多種病原體，提供病原體分型、毒力基因和耐藥基因等深入分析。如果臨床傾向于RNA病毒感染，建議選擇RNA高通量測序。危重癥患者同時(shí)開(kāi)展常規病原學(xué)檢查輔以病原體核酸檢測，兩者可相互補充，有利于快速準確確定致病原，更好地服務(wù)于臨床。

對于有流行病學(xué)史、流感樣癥狀或病情嚴重需要住院治療的AECOPD患者，推薦盡早進(jìn)行流感病毒、新型冠狀病毒等呼吸道病毒的抗原和/或核酸檢測，核酸檢測的敏感性高于抗原檢測。 

免疫功能受損患者，發(fā)生下呼吸道感染時(shí)病原學(xué)構成更加復雜，條件致病菌、少見(jiàn)病原體、混合感染發(fā)生的比例更高，此時(shí)患者病情更重、進(jìn)展更迅速?？煽紤]多種方法并行送檢，臨床常需積極開(kāi)展涵蓋目標病原體的多靶標核酸檢測或 mNGS以盡早診斷致病病原體。